使用场景假设有一个fasta格式的序列文件SRR9620252.faa，我们想要提取其中的一些序列到一个新的文件中，我们拥有这些序列的id （假设这些id存放在文件ids.txt中）。常规操作的话，可以复制id，在fasta文件中打开搜索，

     English Readme | 中文说明 ____ ____ ____ ____ _

安装软件123456789mamba install miniasm minipolish raven-assembler flye medaka python=3.8 fastp bwa masurca trycyclergit clon

EggNOG-mapper简介(本文未完待续…)EggNOG-mapper (a.k.a. emapper.py or just emapper) is a tool for fast functional annotation of no

介绍DeepARG 是一种机器学习解决方案，它使用深度学习来表征和注释宏基因组中的抗生素抗性基因。它由两种输入模型组成：短序列Reads和gene-like序列。 安装软件 通过conda安装 12345678910111213141

蛋白质组的全局 pIs细胞全局蛋白质组 pI 图的变化取决于氨基酸的总电荷，并对蛋白质的结构和特性具有重要意义。 普遍认为原核基因组具有两个最大的双峰形状，一个在酸性pH值下主要对应于溶解的蛋白质（细胞质蛋白或分泌蛋白），另一种在膜蛋白的碱

GTDB-Tk 是一个软件工具包，用于根据基因组数据库分类 GTDBGenome Database Taxonomy GTDB 为细菌和古菌基因组分配客观分类学分类assigning objective taxonomic classifi

安装软件 安装主程序及依赖 :::default VirSorter2 (version >=2.2.3) CheckV (version >=0.7.0) DRAMv (version >=

氮（N）循环是地球生态系统中重要的生物地球化学途径的集合，在生态学和环境研究中得到了广泛的关注。目前，鸟枪法宏基因组测序Shotgun metagenome sequencing已被广泛应用于探索负责 N 循环过程的基因家族。NCycDB是

向NCBI提交基因簇的时候需要提供sqn格式的文件，这个文件需要通过tbl2asn生成。 文件准备tbl2asn依赖三个文件来生成sqn文件： 文件1：fasta格式的基因组序列文件 Header处的中括号部分可以不写。 1234567